Sistem Pendidikan, di Pon-Pes Modern Al Fatih Jangkat melaksanakan sistem Pendidikan Kepesantrenan seperti Pesantren pada Umumnya, seperti Kitab Kuning, Bahasa Arab, Bahasa Inggris, Hifdzil Hadits, dan tersedia Program TAHFIDZUL QUR�AN. Sistem pembelajaran juga menjadi dua yaitu kelas pagi  (MTsS) mengajarkan Kurikulum KEMENTERIAN AGAMA, dan Kelas siang hingga ba�da Isya� mengajarkan Kurikulum Kepesantrenan.